關鍵詞

說    明

allele

相關的個體或菌株含有相同基因的穩定的其它形式，該形式區別于這一位置的現有的序列(和或許其它序列)

attenuator

存在調節轉錄的終止的DNA區域，它控制了一些細菌操縱子的表達；位于啟動子和第一個結構基因之間，引起轉錄的部分終止的序列區段

C_region

免疫球蛋白輕和重鏈的恒定區，和T-細胞受體α，β，和γ鏈；根據特定的鏈可包括一個或多個外顯子

CAAT_signal

CAAT盒；位于可能參與RNA聚合酶結合的真核生物轉錄單位的起始點的75bp上游的保守序列的一部分；共有序列=GG(C或T)CAATCT

CDS

編碼序列；對應于蛋白質中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括終止密碼子)；特征包括氨基酸概念上的翻譯

conflict

在這一位點或區域，單獨確定的“相同”序列有所不同

D-loop

置換環；線粒體DNA內的一個區域，其中RNA的短的序列與DNA的一條鏈配對，代替了這一區域的原始配對DNA鏈；也用于說明在RecA蛋白質催化的反應中，侵入的單鏈替代雙鏈DNA的一條鏈的區域

D-segment

免疫球蛋白重鏈的多變區，和T-細胞受體的β鏈

enhancer

順式-作用序列，它增強了(一些)真核生物啟動子的作用，并能在任一方向和與啟動子相關的任何位置處(上游或下游)起作用

exon

編碼剪接mRNA部分的基因組區域；可以含有5'UTR，所有CDS，和3'UTR

GC_signal

GC盒；位于真核生物轉錄單位起始點上游的保守的富含GC區域，可以以多重拷貝
或任一方向存在；共有序列=GGGCGG

gene

鑒定為基因的生物學意義的區域，并已經指定名稱

iDNA

間插DNA；通過幾種重組中的任何一種能被消除的DNA

intron

被轉錄的DNA區段，但通過同時剪接位于其兩側的序列(外顯子)即可從轉錄本內部將其除去

J_segment

免疫球蛋白輕鏈和重鏈的連接區段，和T-細胞受體α，β和γ鏈

LTR

長的末端重復，在確定序列的兩端直接重復的序列，類型典型地見于逆轉錄病毒中

mat_peptide

成熟的肽或蛋白質的編碼序列；翻譯后修飾之后成熟的或最終的肽或蛋白質產物的編碼序列；位置不包括終止密碼子(與相應的CDS不同)

misc_binding

不能用任何其它Binding關鍵詞(primer_bind或protein_bind)表述的與另一個組成成分共價或非-共價結合的核酸中的位點

misc_difference

特征序列與記載中存在的有所不同，并且不能用任何其它不同關鍵詞(conflict，unsure，old_sequence，mutation，variation，allele或modified_base)表述

misc_feature

不能用任何其它的特征關鍵詞表述的具有生物學意義的區域；新的或少見的特征

misc_recomb

任何一般性的，位點特異性的或復制的重組事件的位點，該位點中有不能用其它重組關鍵詞(iDNA和virion)或來源關鍵詞的修飾詞(/insertion_seq，/transposon，/proviral)表述的雙螺旋DNA的斷裂和愈合

misc_RNA

不能用其他RNA關鍵詞(prim_transcript，precursor_RNA，mRNA，5'clip，3'clip，5'UTR，3'UTR，exon，CDS，sig_peptide，transit_peptide，mat_peptide，intron，polyA_site，rRNA，tRNA，scRNA和snRNA)限定的任何轉錄本或RNA產物

misc_signal

含有控制或改變基因功能或表達之信號的任何區域，所述信號不能用其他Signal關鍵詞(promoter，CAAT_signal，TATA_signal，-35_signal，-10_signal，GC_signal，RBS，polyA_signal，enhancer，attenuator，terminator，和rep_origin)表述

misc_structure

不能用其他Structure關鍵詞(stem_loop和D-loop)表述的任何二級或三級結構或構象

modified_base

被指示的核苷酸是經修飾的核苷酸，并應由被指示的分子(在mod_base修飾詞意義中給出)所取代

mRNA

信使RNA；包括5'非翻譯區(5'UTR)，編碼序列(CDS，外顯子)和3'非翻譯區(3'UTR)

mutation

在此位置處，相關品系的序列中具有突發的，可遺傳的變化

N_region

在重排的免疫球蛋白區段之間插入的額外的核苷酸

old_sequence

在此位置處，所表述的序列修改了此序列以前的版本

polyA_signal

聚腺苷酸化之后內切核酸酶裂解RNA轉錄本所必需的識別區域；共有序列=AATAAA

polyA_site

RNA轉錄本上的位點，通過轉錄后聚腺苷酸化該位點將被加上腺嘌呤殘基

precursor_RNA

仍不是成熟的RNA產物的任何RNA種類；可包括5'剪切區(5'clip)，5'非翻譯區(5'UTR)，編碼序列(CDS，外顯子)，間插序列(內含子)，3'非翻譯區(3'UTR)，和3'剪切區(3'clip)

prim_transcript

初級(最初的，未加工的)轉錄本；包括5'剪切區(5'clip)，5'非翻譯區(5'UTR)，編碼序列(CDS，外顯子)，間插序列(內含子)，3'非翻譯區(3'UTR)和3'剪切區(3'clip)

primer_bind

起始復制，轉錄或逆轉錄的非－共價的引物結合位點；包括合成的例如PCR引物元件的位點

promoter

參與RNA聚合酶的結合以啟動轉錄的DNA分子區域

protein_bind

核酸上非－共價的蛋白質結合位點

RBS

核糖體結合位點

repeat_region

含有重復單位的基因組區域

repeat_unit

單個重復元件

rep_origin

復制起點；復制核酸以得到兩個相同拷貝的起始位點

rRNA

成熟的核糖體RNA；將氨基酸裝配成蛋白質的核糖核蛋白顆粒(核糖體)中的RNA成份

S_region

免疫球蛋白重鏈的開關區；它參與重鏈DNA的重排，導致來自相同B－細胞的不同免疫球蛋白類的表達

satellite

短的基本重復單位的很多串聯重復(相同或相關的)；大多數具有的堿基組成或其它性質與基因組的一般水平不同，這使得它們與大部分(主帶)的基因組DNA分離開來

scRNA

小的細胞質RNA；幾個小的細胞質RNA分子中的任何一個存在于真核生物的細胞質和(有時)核中

sig_peptide

信號肽編碼序列；被分泌的蛋白質的N－末端結構域的編碼序列；此結構域涉及新生多肽與膜的結合；前導序列

snRNA

小的核RNA；很多小的RNA種類中的任何一個都被局限于核中；幾個snRNA參與剪接或其它RNA加工反應

source

鑒定序列中特定范圍的生物來源；此關鍵詞是強制性的；每一項至少要有一個跨越整個序列的單一來源關鍵詞；每個序列可允許有一個以上的來源關鍵詞

stem_loop

發卡結構；由RNA或DNA單鏈的相鄰(反向)互補序列之間的堿基一配對形成的雙螺旋區域

STS

序列標記位點：表述基因組上作圖界標并能通過PCR檢測的短的，單拷貝DNA序列；通過測定STS系列的次序即可作出圖譜的基因組區域

TATA_signal

TATA盒；Goldberg-Hogness盒；在每個真核生物RNA聚合酶Ⅱ轉錄單位起點前約25bp處發現的保守的富含AT的七聚體，它可能涉及使酶定位以正確地起始；共有序列=TATA(A或T)A(A或T)

terminator

或者位于轉錄本的末端或者與啟動子區域相鄰的DNA序列，該序列可導致RNA聚合酶終止轉錄；也可以是阻抑蛋白的結合位點

transit_peptide

轉運肽編碼序列；核編碼的細胞器蛋白質N-末端結構域的編碼序列；此結構域參與將蛋白質翻譯后運送到細胞器中

tRNA

成熟的轉移RNA，小的RNA分子(75－85個堿基長)，介導核酸序列翻譯成氨基酸序列

unsure

作者不能確定此區域的準確序列

V_region

免疫球蛋白輕鏈和重鏈的可變區，和T－細胞受體α，β和γ鏈；編碼可變的氨基末端部分；可由V_segment，D_segment，N_region和J_segment組成

V_segment

免疫球蛋白輕鏈和重鏈的可變區段，和T-細胞受體α，β和γ鏈；編碼大多數可變區(v_region)和前導肽的最后幾個氨基酸

variation

含有來自相同基因的穩定突變的相關系列(例如RFLP，多態性等)，在此(和可能其它)位置處所述相同基因與被表述的不同

3’clip

在加工過程中被切下的前體轉錄本3'端大部分區域

3’UTR

不被翻譯成蛋白質的成熟轉錄本的3'末端區域(終止密碼子之后)

5’clip

在加工過程中被切下的前體轉錄本5'端大部分區域

5’UTR

不被翻譯成蛋白質的成熟轉錄本的5'末端區域(起始密碼子之前)

-10_signal

Pribnow盒；細菌轉錄單位起點上游約10bp處的保守區域，它可能參與結合RNA聚合酶；共有序列=TatAaT

-35_signal

細菌轉錄單位起點上游約35bp處的保守六聚體；共有序列=TTGACa[]或TGTTGACA[]